澎湖寨巡检司，或称澎湖巡检司，设置于澎湖群岛。设治时间以1281年（元世祖至元十八年）的考证最为早，也就是根据一般史书及元史、新元史，考定：“蒙元世祖远征日本因风失败，迂回台湾，道经澎湖设治澎湖，企图进取台湾，作为征日本之准备。”
