A、单独利用甲基绿对细胞染色可显示DNA在细胞中的分布从而推知DNA分布,A错误; B、单独利用吡罗红对细胞染色可显示RNA在细胞中的分布从而推知RNA分布,B错误; C、同时利用甲基绿、吡罗红对细胞染色,由于甲基绿能将DNA染成绿色,吡罗红能将RNA染成红色,所以可以同时可显示DNA、RNA在细胞中的分布,C正确; D、本实验的原理是:甲基绿和吡罗红对DNA和RNA的亲和力不同,甲基绿能将DNA染成绿色,吡罗红能将RNA染成红色,D错误.故选:C.